Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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