Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms