Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gtf3c6Q9D8P7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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