Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms