Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms