Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rab11fip3Q8CHD8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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