Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Usp27Q8CEG8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms