Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms