Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RgmaQ6PCX7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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RgmaQ6PCX7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RgmaQ6PCX7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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