Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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