Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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