Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms