Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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