Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem27Q9ESG4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms