Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl4Q9DCU6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms