Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Abcf3Q8K268 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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