Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg4dQ8BGV9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms