Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms