Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SgcdP82347 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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