Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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