Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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