Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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