Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifna9P09235 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms