Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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