Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubxn4Q8VCH8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubxn4Q8VCH8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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