Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms