Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Copz1P61924 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms