Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd8P23463 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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