Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18524 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms