Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms