Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms