Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Myo5cE9Q1F5 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms