Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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