Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ctdnep1Q3TP92 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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