Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Treml4Q3LRV9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Treml4Q3LRV9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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