Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrriq3Q14DL3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrriq3Q14DL3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms