Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Irx1P81068 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms