Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx2P81066 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms