Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms