Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms