Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms