Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd1d1P11609 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Cd1d1P11609 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms