Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Efna3O08545 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms