Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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