Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Stx18Q8VDS8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms