Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim28Q62318 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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