Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms