Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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