Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms