Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms